Baca juga: Peneliti beri 5.000 KTP Pohon di Kebun Raya Bogor, ini tujuannya
Selain itu ada area konservasi Jawa-Bali seluas sekitar 10 hektare yang memiliki replika hutan non-dipterocarpa pamah dengan tumbuhan khas seperti pohon kepel (maskot flora Yogyakarta), gandaria (maskot flora Jawa Barat), buni, pule, trengguli, dan aren.
Selama berada di Kebun Raya Cibinong, pengunjung dapat mengenal dan belajar tentang tumbuhan sambil menikmati pemandangan Danau Dora, danau buatan dengan hamparan tanaman air tetepok berbunga putih kecil yang tampak seperti serpihan salju.
Keberadaan Kebun Raya Cibinong bermula dari pembangunan taman ekologi, taman konservasi alam yang menjadi bagian dari Pusat Konservasi Tumbuhan Kebun Raya Bogor.
Pembangunan taman ekologi itu dirintis tahun 2002. Pada awal pembangunan, taman ekologi tersebut memiliki koleksi lebih dari 10.000 pohon.